根据政府的指示，日本的动物保护中心位于各大城市和市区。

这些设施机构（日本的动物保护中心）的总数在全国达120个。

政府公布了管理的基本政策，但对这些保护中心的实际管理由当地政府委托。

日本的动物保护中心接收流浪动物和被遗弃的动物，但基本上保护中心拒绝接收主人带来的宠物动物。

流浪动物和被遗弃的动物在保护中心停留的时间取决于所处区域，情况有：

1. 小于7天

2. 小于14天（大多数情况）

3. 没有时间限制（罕见情况）

在动物被收留的时间内，保护中心借助互联网、新闻信件、与当地的动物福利组织合作帮助流浪和被遗弃的动物们寻找新家。

多数当地的动物福利组织在流浪和被遗弃的动物被杀死之前将它们带到自己的收容地，但并不是全部动物福利组织都会如此。

流浪动物和被遗弃的动物被杀死的条件有：

1. 接受治疗后生存希望仍然渺茫的流浪动物和被遗弃的动物。

2. 带有攻击性的好斗的流浪动物和被遗弃的动物。

3. 在规定时间内找不到新家的流浪动物和被遗弃的动物。

（数据显示的“零处死”，有2%的例外情况）

一些动物保护中心近期停止处死流浪动物和被遗弃的动物。

多数停止处死流浪动物和被遗弃的动物的保护中心经由当地动物福利组织支持，这些机构不设收养限额，它们也从未获得过政府的资助。